1e keus: chloorhexidine oogdruppels 0,02% met/zonder propamidine isethionaat (Brolene) 0,1%

Polyhexamethyleenbiguanide (PHMB) is een alternatieve behandeling maar beschikbaarheid in Nederland is beperkt. 

Gebruik van aminoglycosiden zoals gentamicine, tobramycine en neomycine wordt afgeraden omdat deze middelen cystevorming induceren.

Het gebruik van corticosteroïd oogdruppels is gecontraïndiceerd bij (verdenking op) Acanthamoeba-keratitis.

Bij verdenking op Acanthamoeba-infectie contact opnemen met dienstdoende parasitoloog via de centrale van het AmsterdamUMC.